ไทยและบาห์เรนได้ลงนามในกรอบความตกลงการเป็นพันธมิตรทางเศรษฐกิจไทย-บาห์เรน (Framework Agreement on Closer Economic Partnership between The Kingdom of Thailand and The Kingdom of Bahrain) เพื่อให้ความตกลงฯ มีผลบังคับใช้ เมื่อวันที่ 29 ธันวาคม 2545 ซึ่งต่อมา ทั้งสองฝ่ายได้เห็นชอบให้จัดตั้งคณะทำงานด้านเทคนิคไทย-บาห์เรน (Technical Expert Group: TEG) เพื่อจัดทำรายละเอียดความตกลง CEP รวมทั้งการจัดตั้งเขตการค้าเสรีระหว่างกัน โดยจะครอบคลุมเรื่องการค้าเปิดเสรีด้านสินค้า การค้าบริการและการลงทุน และความร่วมมือด้านเศรษฐกิจ (รายละเอียดกรอบความตกลงการเป็นพันธมิตรทางเศรษฐกิจไทย-บาห์เรน)

ทั้งสองฝ่ายได้แบ่งแนวทางการลดภาษีสินค้าออกเป็น 2 ส่วน ได้แก่ การลดภาษีสินค้าเบื้องต้น (Early Harvest: EH) และการลดภาษีสินค้าทั่วไป

- การลดภาษีสินค้าเบื้องต้น (Early Harvest: EH): ทั้งสองฝ่ายได้เจรจาจัดทำรายการสินค้าที่จะลดภาษีในเบื้องต้น จำนวน 626 รายการ โดยจะลดภาษีลงเหลือ 0 และ 3% ทันทีเมื่อความตกลงมีผลบังคับใช้ อาทิ ข้าวและสินค้าหมวดอาหาร น้ำมันสำเร็จรูปและก๊าซธรรมชาติ ผลิตภัณฑ์พลาสติก สิ่งทอและเครื่องนุ่งห่ม อะลูมิเนียม เครื่องปรับอากาศ เคมีภัณฑ์ เสื้อผ้าสตรี อัญมณีและเครื่องประดับ เป็นต้น (รายการสินค้าที่ตกลงจะลดภาษีในเบื้องต้น)

อย่างไรก็ตาม ในช่วงปลายปี 2547 ฝ่ายบาห์เรนได้แจ้งว่า มีปัญหาในการดำเนินการ ภายในที่จะลดภาษีเฉพาะสินค้า Early Harvest จึงขอเปลี่ยนรูปแบบการเจรจาให้ครอบคลุม ทุกรายการ โดยให้นำรายการสินค้า Early Harvest มารวมในความตกลงฉบับเดียว

- การลดภาษีสินค้าทั่วไป: ทั้งสองฝ่ายจะเจรจาลดภาษีให้แล้วเสร็จภายในปี 2553 โดยแบ่งรายการสินค้าออกเป็น 3 กลุ่ม ดังนี้

ทั้งสองฝ่ายได้แลกเปลี่ยนข้อมูลในเรื่องการค้าบริการในภาพกว้าง และประเด็นที่เกี่ยวกับกฎระเบียบภายในของแต่ละประเทศ และได้ระบุสาขาที่แต่ละฝ่ายสนใจและให้ความสำคัญ โดยสาขาที่ฝ่ายบาห์เรนให้ความสนใจ ได้แก่ การเงิน บริการสาธารณสุข เทคโนโลยีสารสนเทศ การขนส่งและโทรคมนาคม และสาขาที่ฝ่ายไทยให้ความสนใจ ได้แก่ ธุรกิจบริการ การก่อสร้าง การศึกษา บริการสาธารณสุข การท่องเที่ยว และนันทนาการ ซึ่งขณะนี้ ทั้งสองฝ่ายอยู่ระหว่างการยื่นข้อเรียกร้องและข้อเสนอสาขาที่จะเปิดเสรีระหว่างกัน

ทั้งสองฝ่ายกำหนดว่าจะร่วมมือกันในสาขาต่างๆ เช่น พลังงาน การเงินและการประกันภัย การจัดซื้อจัดจ้างโดยรัฐ การเคลื่อนย้ายนักธุรกิจ การขนส่ง การประมง เทคโนโลยีสารสนเทศและคมนาคม พิธีการศุลกากร และการกักกันโรคติดต่อ เป็นต้น